Protein–RNA interactions for Protein: P49023

PXN, Paxillin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXNP49023 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PXNP49023 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PXNP49023 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PXNP49023 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PXNP49023 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PXNP49023 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PXNP49023 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PXNP49023 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PXNP49023 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PXNP49023 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PXNP49023 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PXNP49023 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PXNP49023 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PXNP49023 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PXNP49023 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PXNP49023 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PXNP49023 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PXNP49023 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PXNP49023 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PXNP49023 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PXNP49023 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PXNP49023 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PXNP49023 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PXNP49023 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PXNP49023 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PXNP49023 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PXNP49023 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PXNP49023 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PXNP49023 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PXNP49023 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PXNP49023 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PXNP49023 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PXNP49023 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PXNP49023 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PXNP49023 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PXNP49023 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PXNP49023 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PXNP49023 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PXNP49023 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PXNP49023 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PXNP49023 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PXNP49023 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PXNP49023 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PXNP49023 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PXNP49023 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PXNP49023 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PXNP49023 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PXNP49023 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PXNP49023 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PXNP49023 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PXNP49023 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PXNP49023 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PXNP49023 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PXNP49023 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PXNP49023 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PXNP49023 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PXNP49023 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PXNP49023 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PXNP49023 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PXNP49023 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PXNP49023 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PXNP49023 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PXNP49023 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PXNP49023 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PXNP49023 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PXNP49023 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PXNP49023 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PXNP49023 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PXNP49023 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PXNP49023 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PXNP49023 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PXNP49023 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PXNP49023 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PXNP49023 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PXNP49023 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PXNP49023 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PXNP49023 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PXNP49023 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PXNP49023 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PXNP49023 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PXNP49023 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PXNP49023 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PXNP49023 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PXNP49023 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PXNP49023 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PXNP49023 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PXNP49023 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PXNP49023 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PXNP49023 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PXNP49023 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PXNP49023 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PXNP49023 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PXNP49023 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PXNP49023 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PXNP49023 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PXNP49023 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PXNP49023 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PXNP49023 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PXNP49023 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PXNP49023 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms