Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LHX1P48742 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX1P48742 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX1P48742 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX1P48742 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX1P48742 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX1P48742 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX1P48742 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX1P48742 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX1P48742 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX1P48742 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX1P48742 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX1P48742 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX1P48742 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX1P48742 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX1P48742 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX1P48742 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX1P48742 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LHX1P48742 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX1P48742 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX1P48742 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX1P48742 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX1P48742 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX1P48742 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX1P48742 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX1P48742 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX1P48742 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX1P48742 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX1P48742 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX1P48742 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX1P48742 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX1P48742 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX1P48742 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LHX1P48742 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX1P48742 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX1P48742 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX1P48742 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX1P48742 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX1P48742 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX1P48742 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX1P48742 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX1P48742 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX1P48742 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LHX1P48742 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX1P48742 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX1P48742 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX1P48742 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX1P48742 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX1P48742 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX1P48742 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX1P48742 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX1P48742 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX1P48742 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX1P48742 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX1P48742 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX1P48742 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX1P48742 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX1P48742 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LHX1P48742 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX1P48742 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX1P48742 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX1P48742 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX1P48742 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX1P48742 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX1P48742 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX1P48742 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LHX1P48742 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX1P48742 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX1P48742 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX1P48742 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX1P48742 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX1P48742 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX1P48742 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX1P48742 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX1P48742 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LHX1P48742 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX1P48742 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX1P48742 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX1P48742 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX1P48742 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX1P48742 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX1P48742 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX1P48742 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX1P48742 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX1P48742 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX1P48742 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX1P48742 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX1P48742 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX1P48742 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX1P48742 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX1P48742 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX1P48742 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX1P48742 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX1P48742 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX1P48742 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX1P48742 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX1P48742 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX1P48742 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LHX1P48742 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LHX1P48742 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms