Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
NESP48681 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
NESP48681 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
NESP48681 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
NESP48681 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
NESP48681 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
NESP48681 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
NESP48681 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
NESP48681 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
NESP48681 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
NESP48681 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
NESP48681 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
NESP48681 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
NESP48681 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
NESP48681 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
NESP48681 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
NESP48681 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
NESP48681 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
NESP48681 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
NESP48681 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
NESP48681 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
NESP48681 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
NESP48681 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
NESP48681 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
NESP48681 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
NESP48681 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
NESP48681 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
NESP48681 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
NESP48681 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
NESP48681 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
NESP48681 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
NESP48681 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
NESP48681 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
NESP48681 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
NESP48681 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC37.54■■■■□ 3.6
NESP48681 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
NESP48681 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
NESP48681 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
NESP48681 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
NESP48681 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
NESP48681 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
NESP48681 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
NESP48681 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
NESP48681 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
NESP48681 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
NESP48681 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
NESP48681 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
NESP48681 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
NESP48681 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
NESP48681 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
NESP48681 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
NESP48681 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
NESP48681 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
NESP48681 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
NESP48681 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
NESP48681 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
NESP48681 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
NESP48681 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
NESP48681 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
NESP48681 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
NESP48681 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
NESP48681 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
NESP48681 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
NESP48681 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
NESP48681 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
NESP48681 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
NESP48681 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
NESP48681 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
NESP48681 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
NESP48681 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
NESP48681 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
NESP48681 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NESP48681 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
NESP48681 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
NESP48681 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NESP48681 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NESP48681 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NESP48681 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NESP48681 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
NESP48681 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
NESP48681 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
NESP48681 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC37.48■■■■□ 3.59
NESP48681 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
NESP48681 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
NESP48681 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
NESP48681 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
NESP48681 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
NESP48681 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
NESP48681 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC37.47■■■■□ 3.59
NESP48681 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NESP48681 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
NESP48681 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NESP48681 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
NESP48681 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
NESP48681 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
NESP48681 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
NESP48681 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
NESP48681 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
NESP48681 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
NESP48681 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms