Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCLMP48507 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GCLMP48507 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCLMP48507 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCLMP48507 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GCLMP48507 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GCLMP48507 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCLMP48507 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCLMP48507 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCLMP48507 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCLMP48507 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCLMP48507 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCLMP48507 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCLMP48507 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GCLMP48507 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCLMP48507 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCLMP48507 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCLMP48507 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCLMP48507 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCLMP48507 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCLMP48507 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCLMP48507 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GCLMP48507 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCLMP48507 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCLMP48507 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GCLMP48507 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCLMP48507 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCLMP48507 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCLMP48507 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCLMP48507 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCLMP48507 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCLMP48507 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCLMP48507 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GCLMP48507 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCLMP48507 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCLMP48507 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCLMP48507 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCLMP48507 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCLMP48507 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCLMP48507 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCLMP48507 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GCLMP48507 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCLMP48507 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCLMP48507 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCLMP48507 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCLMP48507 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCLMP48507 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCLMP48507 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCLMP48507 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCLMP48507 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GCLMP48507 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCLMP48507 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCLMP48507 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCLMP48507 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCLMP48507 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GCLMP48507 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCLMP48507 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCLMP48507 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCLMP48507 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCLMP48507 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCLMP48507 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCLMP48507 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GCLMP48507 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCLMP48507 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCLMP48507 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCLMP48507 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCLMP48507 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCLMP48507 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GCLMP48507 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GCLMP48507 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCLMP48507 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GCLMP48507 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCLMP48507 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCLMP48507 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCLMP48507 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCLMP48507 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCLMP48507 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCLMP48507 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GCLMP48507 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCLMP48507 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCLMP48507 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCLMP48507 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCLMP48507 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GCLMP48507 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCLMP48507 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCLMP48507 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCLMP48507 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCLMP48507 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCLMP48507 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCLMP48507 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCLMP48507 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCLMP48507 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GCLMP48507 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCLMP48507 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GCLMP48507 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCLMP48507 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCLMP48507 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCLMP48507 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCLMP48507 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GCLMP48507 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms