Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RXRGP48443 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RXRGP48443 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RXRGP48443 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RXRGP48443 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RXRGP48443 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RXRGP48443 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RXRGP48443 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RXRGP48443 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RXRGP48443 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RXRGP48443 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RXRGP48443 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RXRGP48443 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RXRGP48443 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RXRGP48443 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RXRGP48443 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RXRGP48443 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RXRGP48443 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RXRGP48443 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RXRGP48443 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RXRGP48443 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RXRGP48443 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RXRGP48443 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RXRGP48443 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RXRGP48443 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RXRGP48443 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RXRGP48443 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RXRGP48443 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RXRGP48443 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RXRGP48443 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RXRGP48443 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RXRGP48443 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RXRGP48443 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RXRGP48443 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RXRGP48443 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RXRGP48443 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RXRGP48443 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RXRGP48443 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RXRGP48443 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RXRGP48443 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RXRGP48443 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RXRGP48443 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RXRGP48443 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RXRGP48443 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RXRGP48443 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RXRGP48443 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RXRGP48443 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RXRGP48443 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RXRGP48443 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RXRGP48443 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RXRGP48443 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RXRGP48443 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RXRGP48443 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RXRGP48443 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RXRGP48443 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RXRGP48443 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RXRGP48443 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RXRGP48443 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RXRGP48443 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RXRGP48443 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RXRGP48443 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RXRGP48443 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RXRGP48443 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RXRGP48443 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RXRGP48443 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RXRGP48443 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RXRGP48443 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RXRGP48443 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RXRGP48443 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RXRGP48443 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RXRGP48443 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RXRGP48443 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RXRGP48443 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RXRGP48443 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RXRGP48443 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RXRGP48443 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RXRGP48443 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RXRGP48443 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RXRGP48443 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RXRGP48443 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RXRGP48443 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RXRGP48443 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RXRGP48443 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RXRGP48443 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RXRGP48443 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RXRGP48443 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RXRGP48443 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RXRGP48443 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RXRGP48443 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RXRGP48443 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RXRGP48443 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RXRGP48443 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RXRGP48443 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RXRGP48443 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RXRGP48443 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RXRGP48443 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RXRGP48443 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RXRGP48443 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RXRGP48443 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RXRGP48443 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms