Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PIP4K2AP48426 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIP4K2AP48426 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms