Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNNT3P45378 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNNT3P45378 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms