Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MCAMP43121 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MCAMP43121 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MCAMP43121 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MCAMP43121 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MCAMP43121 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
MCAMP43121 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCAMP43121 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCAMP43121 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCAMP43121 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCAMP43121 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCAMP43121 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCAMP43121 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCAMP43121 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCAMP43121 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCAMP43121 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCAMP43121 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCAMP43121 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCAMP43121 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCAMP43121 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCAMP43121 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCAMP43121 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCAMP43121 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MCAMP43121 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCAMP43121 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCAMP43121 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCAMP43121 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MCAMP43121 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCAMP43121 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCAMP43121 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCAMP43121 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCAMP43121 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCAMP43121 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCAMP43121 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCAMP43121 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MCAMP43121 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCAMP43121 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCAMP43121 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCAMP43121 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCAMP43121 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCAMP43121 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCAMP43121 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCAMP43121 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCAMP43121 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCAMP43121 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCAMP43121 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCAMP43121 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MCAMP43121 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCAMP43121 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCAMP43121 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCAMP43121 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCAMP43121 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCAMP43121 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCAMP43121 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MCAMP43121 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCAMP43121 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCAMP43121 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCAMP43121 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCAMP43121 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCAMP43121 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCAMP43121 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCAMP43121 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MCAMP43121 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MCAMP43121 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MCAMP43121 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MCAMP43121 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MCAMP43121 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MCAMP43121 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MCAMP43121 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MCAMP43121 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
MCAMP43121 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MCAMP43121 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MCAMP43121 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCAMP43121 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCAMP43121 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
MCAMP43121 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCAMP43121 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCAMP43121 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCAMP43121 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCAMP43121 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MCAMP43121 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCAMP43121 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCAMP43121 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCAMP43121 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCAMP43121 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCAMP43121 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCAMP43121 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCAMP43121 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCAMP43121 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCAMP43121 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MCAMP43121 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCAMP43121 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCAMP43121 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCAMP43121 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCAMP43121 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCAMP43121 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCAMP43121 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCAMP43121 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MCAMP43121 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MCAMP43121 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms