Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC1A1P43005 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC1A1P43005 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms