Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PIK3CAP42336 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PIK3CAP42336 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms