Protein–RNA interactions for Protein: P40072

SLX8, E3 ubiquitin-protein ligase complex SLX5-SLX8 subunit SLX8, yeastyeast

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLX8P40072 RPL7AYGL076C 735 nt5.78□□□□□ -1.48
SLX8P40072 YGR039WYGR039W 312 nt5.78□□□□□ -1.48
SLX8P40072 SPO13YHR014W 876 nt5.78□□□□□ -1.48
SLX8P40072 YHR138CYHR138C 345 nt5.78□□□□□ -1.48
SLX8P40072 RPL7BYPL198W 735 nt5.78□□□□□ -1.48
SLX8P40072 YBR062CYBR062C 543 nt5.78□□□□□ -1.48
SLX8P40072 ADF1YCL058W-A 342 nt5.78□□□□□ -1.48
SLX8P40072 DAS1YJL149W 1992 nt5.78□□□□□ -1.48
SLX8P40072 SMF2YHR050W 1650 nt5.78□□□□□ -1.48
SLX8P40072 MCX1YBR227C 1563 nt5.77□□□□□ -1.49
SLX8P40072 TVP15YDR100W 432 nt5.77□□□□□ -1.49
SLX8P40072 SEC20YDR498C 1152 nt5.77□□□□□ -1.49
SLX8P40072 VMA8YEL051W 771 nt5.77□□□□□ -1.49
SLX8P40072 RPS2YGL123W 765 nt5.77□□□□□ -1.49
SLX8P40072 RPS20YHL015W 366 nt5.77□□□□□ -1.49
SLX8P40072 YAR075WYAR075W 474 nt5.77□□□□□ -1.49
SLX8P40072 YOR379CYOR379C 339 nt5.77□□□□□ -1.49
SLX8P40072 ARC40YBR234C 1155 nt5.77□□□□□ -1.49
SLX8P40072 VPS5YOR069W 2028 nt5.77□□□□□ -1.49
SLX8P40072 RAD28YDR030C 1521 nt5.76□□□□□ -1.49
SLX8P40072 KEL1YHR158C 3495 nt5.76□□□□□ -1.49
SLX8P40072 YER119C-AYER119C-A 372 nt5.76□□□□□ -1.49
SLX8P40072 IES3YLR052W 753 nt5.76□□□□□ -1.49
SLX8P40072 YLR297WYLR297W 390 nt5.76□□□□□ -1.49
SLX8P40072 ARC18YLR370C 537 nt5.76□□□□□ -1.49
SLX8P40072 YOL159CYOL159C 516 nt5.76□□□□□ -1.49
SLX8P40072 YOR186WYOR186W 435 nt5.76□□□□□ -1.49
SLX8P40072 YOR225WYOR225W 330 nt5.76□□□□□ -1.49
SLX8P40072 RTC5YOR118W 1704 nt5.76□□□□□ -1.49
SLX8P40072 PES4YFR023W 1836 nt5.76□□□□□ -1.49
SLX8P40072 PRP3YDR473C 1410 nt5.75□□□□□ -1.49
SLX8P40072 YRF1-4YLR466W 4149 nt5.75□□□□□ -1.49
SLX8P40072 YER148W-AYER148W-A 579 nt5.75□□□□□ -1.49
SLX8P40072 BIG1YHR101C 1008 nt5.75□□□□□ -1.49
SLX8P40072 DBP8YHR169W 1296 nt5.75□□□□□ -1.49
SLX8P40072 FLD1YLR404W 858 nt5.75□□□□□ -1.49
SLX8P40072 CMC2YBL059C-A 330 nt5.75□□□□□ -1.49
SLX8P40072 PHO80YOL001W 882 nt5.75□□□□□ -1.49
SLX8P40072 SFM1YOR021C 642 nt5.75□□□□□ -1.49
SLX8P40072 CAM1YPL048W 1248 nt5.75□□□□□ -1.49
SLX8P40072 YAR1YPL239W 603 nt5.75□□□□□ -1.49
SLX8P40072 SUA7YPR086W 1038 nt5.75□□□□□ -1.49
SLX8P40072 ZPR1YGR211W 1461 nt5.75□□□□□ -1.49
SLX8P40072 VTC2YFL004W 2487 nt5.74□□□□□ -1.49
SLX8P40072 AZR1YGR224W 1842 nt5.74□□□□□ -1.49
SLX8P40072 YNL095CYNL095C 1929 nt5.74□□□□□ -1.49
SLX8P40072 HSP78YDR258C 2436 nt5.74□□□□□ -1.49
SLX8P40072 YCL065WYCL065W 369 nt5.74□□□□□ -1.49
SLX8P40072 YER068C-AYER068C-A 432 nt5.74□□□□□ -1.49
SLX8P40072 PET54YGR222W 882 nt5.74□□□□□ -1.49
SLX8P40072 APS3YJL024C 585 nt5.74□□□□□ -1.49
SLX8P40072 UBI4YLL039C 1146 nt5.74□□□□□ -1.49
SLX8P40072 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt5.74□□□□□ -1.49
SLX8P40072 YBL010CYBL010C 843 nt5.74□□□□□ -1.49
SLX8P40072 GLO1YML004C 981 nt5.74□□□□□ -1.49
SLX8P40072 MRP21YBL090W 534 nt5.74□□□□□ -1.49
SLX8P40072 RGS2YOR107W 930 nt5.74□□□□□ -1.49
SLX8P40072 CAT5YOR125C 702 nt5.74□□□□□ -1.49
SLX8P40072 YPL109CYPL109C 1974 nt5.74□□□□□ -1.49
SLX8P40072 PFK1YGR240C 2964 nt5.74□□□□□ -1.49
SLX8P40072 ESC8YOL017W 2145 nt5.74□□□□□ -1.49
SLX8P40072 FAA3YIL009W 2085 nt5.73□□□□□ -1.49
SLX8P40072 MAL11YGR289C 1851 nt5.73□□□□□ -1.49
SLX8P40072 YGL036WYGL036W 2730 nt5.73□□□□□ -1.49
SLX8P40072 THS1YIL078W 2205 nt5.73□□□□□ -1.49
SLX8P40072 YRA1YDR381W 681 nt5.73□□□□□ -1.49
SLX8P40072 SEC4YFL005W 648 nt5.73□□□□□ -1.49
SLX8P40072 TAM41YGR046W 1158 nt5.73□□□□□ -1.49
SLX8P40072 OCA2YNL056W 594 nt5.73□□□□□ -1.49
SLX8P40072 YBR242WYBR242W 717 nt5.73□□□□□ -1.49
SLX8P40072 DSN1YIR010W 1731 nt5.73□□□□□ -1.49
SLX8P40072 THR4YCR053W 1545 nt5.73□□□□□ -1.49
SLX8P40072 ATM1YMR301C 2073 nt5.73□□□□□ -1.49
SLX8P40072 YBL005W-AYBL005W-A 1323 nt5.73□□□□□ -1.49
SLX8P40072 ABF1YKL112W 2196 nt5.72□□□□□ -1.49
SLX8P40072 BNA7YDR428C 786 nt5.72□□□□□ -1.49
SLX8P40072 MAK16YAL025C 921 nt5.72□□□□□ -1.49
SLX8P40072 ERP1YAR002C-A 660 nt5.72□□□□□ -1.49
SLX8P40072 YLR224WYLR224W 1110 nt5.72□□□□□ -1.49
SLX8P40072 RDN58-1RDN58-1 158 nt5.72□□□□□ -1.49
SLX8P40072 RDN58-2RDN58-2 158 nt5.72□□□□□ -1.49
SLX8P40072 YMR153C-AYMR153C-A 336 nt5.72□□□□□ -1.49
SLX8P40072 AMD1YML035C 2433 nt5.72□□□□□ -1.49
SLX8P40072 ACK1YDL203C 1872 nt5.71□□□□□ -1.5
SLX8P40072 TAF12YDR145W 1620 nt5.71□□□□□ -1.5
SLX8P40072 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt5.71□□□□□ -1.5
SLX8P40072 GDI1YER136W 1356 nt5.71□□□□□ -1.5
SLX8P40072 OPT2YPR194C 2634 nt5.71□□□□□ -1.5
SLX8P40072 GIP4YAL031C 2283 nt5.71□□□□□ -1.5
SLX8P40072 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt5.71□□□□□ -1.5
SLX8P40072 SSP120YLR250W 705 nt5.71□□□□□ -1.5
SLX8P40072 YMR173W-AYMR173W-A 1185 nt5.71□□□□□ -1.5
SLX8P40072 APD1YBR151W 951 nt5.71□□□□□ -1.5
SLX8P40072 VPS70YJR126C 2436 nt5.71□□□□□ -1.5
SLX8P40072 MRH4YGL064C 1686 nt5.71□□□□□ -1.5
SLX8P40072 ROK1YGL171W 1695 nt5.71□□□□□ -1.5
SLX8P40072 MTL1YGR023W 1656 nt5.71□□□□□ -1.5
SLX8P40072 SOG2YOR353C 2376 nt5.71□□□□□ -1.5
SLX8P40072 YPS7YDR349C 1791 nt5.7□□□□□ -1.5
SLX8P40072 YJL049WYJL049W 1353 nt5.7□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 33.8 ms