Protein–RNA interactions for Protein: P38646

HSPA9, Stress-70 protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA9P38646 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HSPA9P38646 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HSPA9P38646 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms