Protein–RNA interactions for Protein: P37020

GEF1, Anion/proton exchange transporter GEF1, yeastyeast

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GEF1P37020 SEC4YFL005W 648 nt5.6□□□□□ -1.51
GEF1P37020 PTI1YGR156W 1278 nt5.6□□□□□ -1.51
GEF1P37020 YHL048C-AYHL048C-A 135 nt5.6□□□□□ -1.51
GEF1P37020 YJL007CYJL007C 315 nt5.6□□□□□ -1.51
GEF1P37020 TPK3YKL166C 1197 nt5.6□□□□□ -1.51
GEF1P37020 RCL1YOL010W 1104 nt5.6□□□□□ -1.51
GEF1P37020 PRP43YGL120C 2304 nt5.6□□□□□ -1.51
GEF1P37020 GIP4YAL031C 2283 nt5.6□□□□□ -1.51
GEF1P37020 SFI1YLL003W 2841 nt5.59□□□□□ -1.51
GEF1P37020 YER077CYER077C 2067 nt5.59□□□□□ -1.51
GEF1P37020 OCA5YHL029C 2040 nt5.59□□□□□ -1.51
GEF1P37020 RPL17AYKL180W 555 nt5.59□□□□□ -1.51
GEF1P37020 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt5.59□□□□□ -1.51
GEF1P37020 RPP0YLR340W 939 nt5.59□□□□□ -1.51
GEF1P37020 EPO1YMR124W 2832 nt5.58□□□□□ -1.52
GEF1P37020 GYP6YJL044C 1377 nt5.58□□□□□ -1.52
GEF1P37020 YGR016WYGR016W 573 nt5.58□□□□□ -1.52
GEF1P37020 TIM10YHR005C-A 282 nt5.58□□□□□ -1.52
GEF1P37020 LRP1YHR081W 555 nt5.58□□□□□ -1.52
GEF1P37020 COQ9YLR201C 783 nt5.58□□□□□ -1.52
GEF1P37020 BET5YML077W 480 nt5.58□□□□□ -1.52
GEF1P37020 BUB3YOR026W 1026 nt5.58□□□□□ -1.52
GEF1P37020 BUD21YOR078W 645 nt5.58□□□□□ -1.52
GEF1P37020 YPL205CYPL205C 345 nt5.58□□□□□ -1.52
GEF1P37020 YPR145C-AYPR145C-A 237 nt5.58□□□□□ -1.52
GEF1P37020 THR4YCR053W 1545 nt5.58□□□□□ -1.52
GEF1P37020 SIP5YMR140W 1470 nt5.58□□□□□ -1.52
GEF1P37020 MCP2YLR253W 1710 nt5.57□□□□□ -1.52
GEF1P37020 PDR15YDR406W 4590 nt5.57□□□□□ -1.52
GEF1P37020 ARP5YNL059C 2268 nt5.57□□□□□ -1.52
GEF1P37020 ROT2YBR229C 2865 nt5.57□□□□□ -1.52
GEF1P37020 SLC1YDL052C 912 nt5.57□□□□□ -1.52
GEF1P37020 snR9snR9 187 nt5.57□□□□□ -1.52
GEF1P37020 HOM2YDR158W 1098 nt5.57□□□□□ -1.52
GEF1P37020 SPO73YER046W 432 nt5.57□□□□□ -1.52
GEF1P37020 SPC29YPL124W 762 nt5.57□□□□□ -1.52
GEF1P37020 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt5.57□□□□□ -1.52
GEF1P37020 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt5.57□□□□□ -1.52
GEF1P37020 PKP2YGL059W 1476 nt5.57□□□□□ -1.52
GEF1P37020 KRE2YDR483W 1329 nt5.56□□□□□ -1.52
GEF1P37020 VPS33YLR396C 2076 nt5.56□□□□□ -1.52
GEF1P37020 CBS1YDL069C 690 nt5.56□□□□□ -1.52
GEF1P37020 VAB2YEL005C 849 nt5.56□□□□□ -1.52
GEF1P37020 RGI2YIL057C 495 nt5.56□□□□□ -1.52
GEF1P37020 RPA43YOR340C 981 nt5.56□□□□□ -1.52
GEF1P37020 YPL035CYPL035C 348 nt5.56□□□□□ -1.52
GEF1P37020 MET31YPL038W 534 nt5.56□□□□□ -1.52
GEF1P37020 YRO2YBR054W 1035 nt5.56□□□□□ -1.52
GEF1P37020 PAL1YDR348C 1500 nt5.56□□□□□ -1.52
GEF1P37020 YLR152CYLR152C 1731 nt5.56□□□□□ -1.52
GEF1P37020 DBF4YDR052C 2115 nt5.56□□□□□ -1.52
GEF1P37020 PUB1YNL016W 1362 nt5.55□□□□□ -1.52
GEF1P37020 GCN5YGR252W 1320 nt5.55□□□□□ -1.52
GEF1P37020 RRP3YHR065C 1506 nt5.55□□□□□ -1.52
GEF1P37020 YDR018CYDR018C 1191 nt5.55□□□□□ -1.52
GEF1P37020 AML1YGR001C 747 nt5.55□□□□□ -1.52
GEF1P37020 MNN11YJL183W 1269 nt5.55□□□□□ -1.52
GEF1P37020 OCA2YNL056W 594 nt5.55□□□□□ -1.52
GEF1P37020 YNL122CYNL122C 348 nt5.55□□□□□ -1.52
GEF1P37020 HCM1YCR065W 1695 nt5.55□□□□□ -1.52
GEF1P37020 ULP1YPL020C 1866 nt5.55□□□□□ -1.52
GEF1P37020 MGS1YNL218W 1764 nt5.55□□□□□ -1.52
GEF1P37020 YCT1YLL055W 1596 nt5.55□□□□□ -1.52
GEF1P37020 SWI3YJL176C 2478 nt5.54□□□□□ -1.52
GEF1P37020 PBP4YDL053C 558 nt5.54□□□□□ -1.52
GEF1P37020 DAD1YDR016C 285 nt5.54□□□□□ -1.52
GEF1P37020 LRS4YDR439W 1044 nt5.54□□□□□ -1.52
GEF1P37020 MXR1YER042W 555 nt5.54□□□□□ -1.52
GEF1P37020 RPL8AYHL033C 771 nt5.54□□□□□ -1.52
GEF1P37020 QCR10YHR001W-A 234 nt5.54□□□□□ -1.52
GEF1P37020 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt5.54□□□□□ -1.52
GEF1P37020 IRC18YJL037W 675 nt5.54□□□□□ -1.52
GEF1P37020 YMR254CYMR254C 309 nt5.54□□□□□ -1.52
GEF1P37020 SOL1YNR034W 966 nt5.54□□□□□ -1.52
GEF1P37020 SIL1YOL031C 1266 nt5.54□□□□□ -1.52
GEF1P37020 SKG3YLR187W 3081 nt5.54□□□□□ -1.52
GEF1P37020 YMR102CYMR102C 2505 nt5.54□□□□□ -1.52
GEF1P37020 RIM15YFL033C 5313 nt5.54□□□□□ -1.52
GEF1P37020 JJJ1YNL227C 1773 nt5.54□□□□□ -1.52
GEF1P37020 YOR022CYOR022C 2148 nt5.54□□□□□ -1.52
GEF1P37020 SEG2YKL105C 3399 nt5.53□□□□□ -1.52
GEF1P37020 UBX7YBR273C 1311 nt5.53□□□□□ -1.52
GEF1P37020 MDM30YLR368W 1797 nt5.53□□□□□ -1.52
GEF1P37020 YCR085WYCR085W 354 nt5.53□□□□□ -1.52
GEF1P37020 TGL2YDR058C 981 nt5.53□□□□□ -1.52
GEF1P37020 YDR340WYDR340W 303 nt5.53□□□□□ -1.52
GEF1P37020 LOH1YJL038C 660 nt5.53□□□□□ -1.52
GEF1P37020 YJL193WYJL193W 1209 nt5.53□□□□□ -1.52
GEF1P37020 RPL43BYJR094W-A 279 nt5.53□□□□□ -1.52
GEF1P37020 ILM1YJR118C 612 nt5.53□□□□□ -1.52
GEF1P37020 UTP23YOR004W 765 nt5.53□□□□□ -1.52
GEF1P37020 DIB1YPR082C 432 nt5.53□□□□□ -1.52
GEF1P37020 CUR1YPR158W 759 nt5.53□□□□□ -1.52
GEF1P37020 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt5.53□□□□□ -1.52
GEF1P37020 FYV5YCL058C 459 nt5.53□□□□□ -1.52
GEF1P37020 CIT1YNR001C 1440 nt5.53□□□□□ -1.52
GEF1P37020 GCN20YFR009W 2259 nt5.53□□□□□ -1.52
GEF1P37020 BIT2YBR270C 1638 nt5.52□□□□□ -1.53
GEF1P37020 GRS1YBR121C 2004 nt5.52□□□□□ -1.53
GEF1P37020 snR5snR5 204 nt5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.8 ms