Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBRP36941 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBRP36941 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBRP36941 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBRP36941 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBRP36941 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBRP36941 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LTBRP36941 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBRP36941 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBRP36941 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBRP36941 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBRP36941 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBRP36941 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBRP36941 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBRP36941 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LTBRP36941 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBRP36941 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBRP36941 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBRP36941 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBRP36941 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBRP36941 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBRP36941 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBRP36941 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBRP36941 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBRP36941 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBRP36941 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBRP36941 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBRP36941 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBRP36941 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBRP36941 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBRP36941 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
LTBRP36941 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBRP36941 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBRP36941 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBRP36941 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBRP36941 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBRP36941 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBRP36941 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBRP36941 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBRP36941 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBRP36941 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBRP36941 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBRP36941 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBRP36941 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBRP36941 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBRP36941 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBRP36941 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBRP36941 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBRP36941 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBRP36941 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBRP36941 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBRP36941 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBRP36941 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBRP36941 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LTBRP36941 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTBRP36941 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTBRP36941 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTBRP36941 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTBRP36941 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTBRP36941 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTBRP36941 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTBRP36941 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LTBRP36941 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LTBRP36941 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LTBRP36941 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LTBRP36941 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LTBRP36941 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LTBRP36941 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LTBRP36941 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LTBRP36941 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LTBRP36941 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LTBRP36941 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LTBRP36941 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LTBRP36941 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LTBRP36941 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LTBRP36941 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LTBRP36941 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LTBRP36941 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTBRP36941 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTBRP36941 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTBRP36941 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTBRP36941 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LTBRP36941 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTBRP36941 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
LTBRP36941 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTBRP36941 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTBRP36941 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTBRP36941 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTBRP36941 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTBRP36941 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LTBRP36941 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBRP36941 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBRP36941 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBRP36941 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBRP36941 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBRP36941 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBRP36941 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBRP36941 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBRP36941 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LTBRP36941 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms