Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJC1P36383 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GJC1P36383 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJC1P36383 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJC1P36383 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJC1P36383 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJC1P36383 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJC1P36383 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJC1P36383 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GJC1P36383 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJC1P36383 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJC1P36383 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJC1P36383 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJC1P36383 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJC1P36383 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJC1P36383 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJC1P36383 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GJC1P36383 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GJC1P36383 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
GJC1P36383 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJC1P36383 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJC1P36383 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJC1P36383 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJC1P36383 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJC1P36383 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GJC1P36383 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJC1P36383 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJC1P36383 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GJC1P36383 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJC1P36383 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJC1P36383 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJC1P36383 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJC1P36383 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJC1P36383 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJC1P36383 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJC1P36383 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJC1P36383 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJC1P36383 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJC1P36383 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJC1P36383 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJC1P36383 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GJC1P36383 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GJC1P36383 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJC1P36383 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJC1P36383 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJC1P36383 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJC1P36383 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJC1P36383 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJC1P36383 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJC1P36383 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJC1P36383 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJC1P36383 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJC1P36383 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJC1P36383 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJC1P36383 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJC1P36383 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJC1P36383 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GJC1P36383 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJC1P36383 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GJC1P36383 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GJC1P36383 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GJC1P36383 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJC1P36383 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJC1P36383 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJC1P36383 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJC1P36383 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJC1P36383 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJC1P36383 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJC1P36383 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJC1P36383 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJC1P36383 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJC1P36383 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJC1P36383 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJC1P36383 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJC1P36383 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJC1P36383 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJC1P36383 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJC1P36383 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJC1P36383 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJC1P36383 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJC1P36383 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJC1P36383 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJC1P36383 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJC1P36383 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJC1P36383 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJC1P36383 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJC1P36383 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJC1P36383 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GJC1P36383 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GJC1P36383 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GJC1P36383 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GJC1P36383 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJC1P36383 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJC1P36383 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJC1P36383 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJC1P36383 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJC1P36383 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJC1P36383 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJC1P36383 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJC1P36383 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms