Protein–RNA interactions for Protein: P36222

CHI3L1, Chitinase-3-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHI3L1P36222 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
CHI3L1P36222 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHI3L1P36222 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms