Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HOXD12P35452 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXD12P35452 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXD12P35452 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.33■■□□□ 1
HOXD12P35452 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HOXD12P35452 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD12P35452 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD12P35452 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD12P35452 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD12P35452 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD12P35452 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD12P35452 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD12P35452 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD12P35452 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD12P35452 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD12P35452 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD12P35452 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD12P35452 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD12P35452 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD12P35452 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD12P35452 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HOXD12P35452 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HOXD12P35452 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD12P35452 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HOXD12P35452 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD12P35452 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD12P35452 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD12P35452 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD12P35452 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD12P35452 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD12P35452 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD12P35452 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD12P35452 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD12P35452 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD12P35452 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD12P35452 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HOXD12P35452 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD12P35452 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD12P35452 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD12P35452 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HOXD12P35452 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD12P35452 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD12P35452 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD12P35452 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD12P35452 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD12P35452 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD12P35452 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD12P35452 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD12P35452 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD12P35452 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD12P35452 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HOXD12P35452 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD12P35452 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD12P35452 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD12P35452 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD12P35452 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms