Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
ABCC1P33527 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ABCC1P33527 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC32.45■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
ABCC1P33527 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms