Protein–RNA interactions for Protein: P32004

L1CAM, Neural cell adhesion molecule L1, humanhuman

Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1CAMP32004 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
L1CAMP32004 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
L1CAMP32004 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms