Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
APOBEC3AP31941 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
APOBEC3AP31941 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms