Protein–RNA interactions for Protein: P31323

PRKAR2B, cAMP-dependent protein kinase type II-beta regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR2BP31323 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRKAR2BP31323 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKAR2BP31323 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKAR2BP31323 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKAR2BP31323 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKAR2BP31323 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKAR2BP31323 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKAR2BP31323 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKAR2BP31323 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKAR2BP31323 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKAR2BP31323 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKAR2BP31323 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKAR2BP31323 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKAR2BP31323 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKAR2BP31323 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKAR2BP31323 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKAR2BP31323 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKAR2BP31323 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKAR2BP31323 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKAR2BP31323 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKAR2BP31323 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKAR2BP31323 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKAR2BP31323 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKAR2BP31323 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKAR2BP31323 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKAR2BP31323 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKAR2BP31323 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKAR2BP31323 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKAR2BP31323 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKAR2BP31323 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKAR2BP31323 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKAR2BP31323 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKAR2BP31323 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKAR2BP31323 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKAR2BP31323 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKAR2BP31323 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKAR2BP31323 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKAR2BP31323 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKAR2BP31323 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKAR2BP31323 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKAR2BP31323 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKAR2BP31323 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms