Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC27P30260 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CDC27P30260 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDC27P30260 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDC27P30260 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDC27P30260 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CDC27P30260 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC27P30260 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC27P30260 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC27P30260 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC27P30260 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC27P30260 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC27P30260 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC27P30260 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC27P30260 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC27P30260 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC27P30260 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CDC27P30260 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC27P30260 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC27P30260 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC27P30260 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC27P30260 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC27P30260 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC27P30260 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC27P30260 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC27P30260 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC27P30260 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC27P30260 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CDC27P30260 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC27P30260 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC27P30260 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC27P30260 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC27P30260 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC27P30260 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC27P30260 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC27P30260 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC27P30260 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC27P30260 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC27P30260 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC27P30260 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CDC27P30260 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDC27P30260 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDC27P30260 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDC27P30260 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDC27P30260 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CDC27P30260 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDC27P30260 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CDC27P30260 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC27P30260 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC27P30260 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC27P30260 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC27P30260 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC27P30260 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC27P30260 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC27P30260 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC27P30260 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC27P30260 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC27P30260 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC27P30260 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC27P30260 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC27P30260 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC27P30260 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC27P30260 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC27P30260 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC27P30260 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC27P30260 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC27P30260 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CDC27P30260 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC27P30260 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC27P30260 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC27P30260 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC27P30260 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC27P30260 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC27P30260 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC27P30260 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC27P30260 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CDC27P30260 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC27P30260 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC27P30260 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC27P30260 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC27P30260 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC27P30260 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC27P30260 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC27P30260 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CDC27P30260 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDC27P30260 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDC27P30260 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDC27P30260 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDC27P30260 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDC27P30260 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDC27P30260 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CDC27P30260 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC27P30260 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC27P30260 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC27P30260 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC27P30260 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC27P30260 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC27P30260 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC27P30260 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CDC27P30260 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms