Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SSFA2P28290 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.58■■■□□ 2
SSFA2P28290 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SSFA2P28290 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SSFA2P28290 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SSFA2P28290 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SSFA2P28290 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SSFA2P28290 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SSFA2P28290 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SSFA2P28290 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SSFA2P28290 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SSFA2P28290 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SSFA2P28290 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SSFA2P28290 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SSFA2P28290 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SSFA2P28290 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SSFA2P28290 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SSFA2P28290 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SSFA2P28290 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SSFA2P28290 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SSFA2P28290 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SSFA2P28290 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SSFA2P28290 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SSFA2P28290 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SSFA2P28290 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SSFA2P28290 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SSFA2P28290 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SSFA2P28290 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SSFA2P28290 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SSFA2P28290 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SSFA2P28290 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SSFA2P28290 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SSFA2P28290 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SSFA2P28290 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SSFA2P28290 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SSFA2P28290 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SSFA2P28290 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SSFA2P28290 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SSFA2P28290 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SSFA2P28290 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SSFA2P28290 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SSFA2P28290 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SSFA2P28290 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SSFA2P28290 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SSFA2P28290 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SSFA2P28290 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SSFA2P28290 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SSFA2P28290 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SSFA2P28290 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SSFA2P28290 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SSFA2P28290 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SSFA2P28290 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SSFA2P28290 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SSFA2P28290 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SSFA2P28290 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms