Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PLNP26678 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PLNP26678 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PLNP26678 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PLNP26678 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLNP26678 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PLNP26678 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PLNP26678 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PLNP26678 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PLNP26678 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PLNP26678 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLNP26678 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PLNP26678 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
PLNP26678 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PLNP26678 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PLNP26678 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLNP26678 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLNP26678 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLNP26678 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLNP26678 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
PLNP26678 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PLNP26678 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLNP26678 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC15.06■□□□□ 0
PLNP26678 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLNP26678 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PLNP26678 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLNP26678 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
PLNP26678 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLNP26678 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLNP26678 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLNP26678 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLNP26678 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLNP26678 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLNP26678 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PLNP26678 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
PLNP26678 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
PLNP26678 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PLNP26678 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
PLNP26678 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PLNP26678 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PLNP26678 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PLNP26678 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
PLNP26678 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PLNP26678 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PLNP26678 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PLNP26678 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PLNP26678 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PLNP26678 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PLNP26678 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PLNP26678 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PLNP26678 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PLNP26678 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PLNP26678 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PLNP26678 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PLNP26678 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PLNP26678 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PLNP26678 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.05■□□□□ -0
PLNP26678 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PLNP26678 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
PLNP26678 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
PLNP26678 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PLNP26678 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
PLNP26678 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PLNP26678 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLNP26678 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLNP26678 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PLNP26678 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PLNP26678 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PLNP26678 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PLNP26678 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLNP26678 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLNP26678 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PLNP26678 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
PLNP26678 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLNP26678 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLNP26678 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLNP26678 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PLNP26678 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLNP26678 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PLNP26678 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PLNP26678 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
PLNP26678 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
PLNP26678 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLNP26678 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLNP26678 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLNP26678 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLNP26678 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLNP26678 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLNP26678 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLNP26678 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLNP26678 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PLNP26678 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLNP26678 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLNP26678 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PLNP26678 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLNP26678 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLNP26678 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PLNP26678 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PLNP26678 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PLNP26678 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms