Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
POLR2AP24928 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
POLR2AP24928 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POLR2AP24928 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms