Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FGFR3P22607 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FGFR3P22607 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms