Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCP20941 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCP20941 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCP20941 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDCP20941 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDCP20941 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDCP20941 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDCP20941 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDCP20941 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDCP20941 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDCP20941 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDCP20941 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDCP20941 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDCP20941 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDCP20941 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDCP20941 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDCP20941 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCP20941 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCP20941 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCP20941 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCP20941 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCP20941 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCP20941 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCP20941 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCP20941 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCP20941 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCP20941 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCP20941 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDCP20941 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCP20941 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCP20941 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCP20941 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCP20941 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCP20941 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCP20941 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCP20941 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCP20941 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDCP20941 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDCP20941 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDCP20941 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDCP20941 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDCP20941 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDCP20941 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDCP20941 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDCP20941 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDCP20941 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDCP20941 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDCP20941 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDCP20941 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDCP20941 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDCP20941 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDCP20941 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDCP20941 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDCP20941 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDCP20941 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDCP20941 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDCP20941 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDCP20941 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDCP20941 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDCP20941 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDCP20941 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDCP20941 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDCP20941 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDCP20941 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDCP20941 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDCP20941 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDCP20941 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDCP20941 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDCP20941 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDCP20941 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDCP20941 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCP20941 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCP20941 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCP20941 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCP20941 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCP20941 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCP20941 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCP20941 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCP20941 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCP20941 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCP20941 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCP20941 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCP20941 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDCP20941 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCP20941 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCP20941 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCP20941 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCP20941 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCP20941 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCP20941 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCP20941 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCP20941 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCP20941 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCP20941 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCP20941 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCP20941 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCP20941 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDCP20941 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCP20941 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDCP20941 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms