Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF3P20783 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF3P20783 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF3P20783 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF3P20783 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF3P20783 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF3P20783 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF3P20783 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF3P20783 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF3P20783 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF3P20783 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF3P20783 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF3P20783 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF3P20783 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF3P20783 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF3P20783 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF3P20783 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF3P20783 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NTF3P20783 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF3P20783 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF3P20783 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF3P20783 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF3P20783 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF3P20783 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF3P20783 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF3P20783 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF3P20783 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF3P20783 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF3P20783 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF3P20783 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF3P20783 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF3P20783 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF3P20783 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NTF3P20783 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTF3P20783 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTF3P20783 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTF3P20783 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTF3P20783 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTF3P20783 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTF3P20783 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTF3P20783 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTF3P20783 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTF3P20783 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTF3P20783 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTF3P20783 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTF3P20783 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTF3P20783 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NTF3P20783 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTF3P20783 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTF3P20783 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTF3P20783 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTF3P20783 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTF3P20783 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTF3P20783 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTF3P20783 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTF3P20783 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTF3P20783 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTF3P20783 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTF3P20783 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTF3P20783 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTF3P20783 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTF3P20783 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTF3P20783 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTF3P20783 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTF3P20783 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTF3P20783 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTF3P20783 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTF3P20783 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTF3P20783 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTF3P20783 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NTF3P20783 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTF3P20783 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTF3P20783 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTF3P20783 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTF3P20783 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTF3P20783 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTF3P20783 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTF3P20783 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTF3P20783 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTF3P20783 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTF3P20783 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTF3P20783 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTF3P20783 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTF3P20783 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NTF3P20783 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTF3P20783 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTF3P20783 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTF3P20783 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTF3P20783 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTF3P20783 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTF3P20783 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTF3P20783 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NTF3P20783 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTF3P20783 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTF3P20783 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTF3P20783 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTF3P20783 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTF3P20783 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTF3P20783 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NTF3P20783 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms