Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMY2BP19961 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMY2BP19961 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMY2BP19961 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMY2BP19961 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMY2BP19961 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMY2BP19961 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMY2BP19961 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMY2BP19961 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMY2BP19961 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMY2BP19961 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMY2BP19961 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMY2BP19961 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMY2BP19961 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMY2BP19961 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
AMY2BP19961 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMY2BP19961 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMY2BP19961 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
AMY2BP19961 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMY2BP19961 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMY2BP19961 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMY2BP19961 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMY2BP19961 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AMY2BP19961 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMY2BP19961 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMY2BP19961 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMY2BP19961 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMY2BP19961 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMY2BP19961 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMY2BP19961 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMY2BP19961 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMY2BP19961 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMY2BP19961 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMY2BP19961 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
AMY2BP19961 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMY2BP19961 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
AMY2BP19961 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMY2BP19961 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMY2BP19961 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMY2BP19961 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMY2BP19961 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMY2BP19961 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMY2BP19961 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMY2BP19961 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMY2BP19961 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AMY2BP19961 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
AMY2BP19961 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms