Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CXCL3P19876 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CXCL3P19876 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms