Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL17P18621 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL17P18621 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL17P18621 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL17P18621 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL17P18621 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL17P18621 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL17P18621 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL17P18621 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL17P18621 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL17P18621 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL17P18621 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL17P18621 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL17P18621 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL17P18621 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL17P18621 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL17P18621 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL17P18621 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL17P18621 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL17P18621 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL17P18621 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL17P18621 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL17P18621 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL17P18621 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL17P18621 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL17P18621 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL17P18621 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL17P18621 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL17P18621 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL17P18621 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL17P18621 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL17P18621 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL17P18621 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL17P18621 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL17P18621 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL17P18621 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL17P18621 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL17P18621 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL17P18621 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL17P18621 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL17P18621 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL17P18621 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL17P18621 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL17P18621 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL17P18621 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL17P18621 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL17P18621 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL17P18621 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL17P18621 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL17P18621 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL17P18621 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL17P18621 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL17P18621 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL17P18621 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL17P18621 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL17P18621 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL17P18621 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL17P18621 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL17P18621 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL17P18621 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL17P18621 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL17P18621 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL17P18621 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL17P18621 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL17P18621 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL17P18621 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPL17P18621 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL17P18621 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL17P18621 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL17P18621 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL17P18621 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL17P18621 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL17P18621 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL17P18621 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL17P18621 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL17P18621 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL17P18621 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL17P18621 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL17P18621 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL17P18621 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL17P18621 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL17P18621 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL17P18621 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL17P18621 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL17P18621 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL17P18621 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL17P18621 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL17P18621 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL17P18621 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL17P18621 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL17P18621 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL17P18621 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL17P18621 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL17P18621 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL17P18621 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL17P18621 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL17P18621 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL17P18621 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL17P18621 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL17P18621 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms