Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PTPN1P18031 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTPN1P18031 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms