Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SYN1P17600 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYN1P17600 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYN1P17600 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYN1P17600 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYN1P17600 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYN1P17600 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYN1P17600 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SYN1P17600 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYN1P17600 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYN1P17600 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYN1P17600 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYN1P17600 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYN1P17600 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYN1P17600 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYN1P17600 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYN1P17600 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYN1P17600 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SYN1P17600 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYN1P17600 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYN1P17600 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SYN1P17600 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYN1P17600 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SYN1P17600 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYN1P17600 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYN1P17600 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYN1P17600 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYN1P17600 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYN1P17600 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYN1P17600 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYN1P17600 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYN1P17600 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SYN1P17600 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYN1P17600 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYN1P17600 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SYN1P17600 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SYN1P17600 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYN1P17600 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYN1P17600 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYN1P17600 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYN1P17600 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYN1P17600 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYN1P17600 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYN1P17600 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYN1P17600 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SYN1P17600 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYN1P17600 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYN1P17600 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYN1P17600 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYN1P17600 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYN1P17600 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYN1P17600 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYN1P17600 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SYN1P17600 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYN1P17600 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYN1P17600 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYN1P17600 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYN1P17600 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYN1P17600 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SYN1P17600 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYN1P17600 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYN1P17600 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYN1P17600 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYN1P17600 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SYN1P17600 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SYN1P17600 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SYN1P17600 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYN1P17600 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYN1P17600 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYN1P17600 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYN1P17600 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYN1P17600 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SYN1P17600 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SYN1P17600 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYN1P17600 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SYN1P17600 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYN1P17600 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYN1P17600 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYN1P17600 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYN1P17600 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYN1P17600 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYN1P17600 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYN1P17600 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYN1P17600 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYN1P17600 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYN1P17600 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SYN1P17600 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYN1P17600 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYN1P17600 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYN1P17600 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYN1P17600 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYN1P17600 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYN1P17600 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYN1P17600 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SYN1P17600 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SYN1P17600 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYN1P17600 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYN1P17600 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYN1P17600 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SYN1P17600 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms