Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PDGFRAP16234 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PDGFRAP16234 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms