Protein–RNA interactions for Protein: P15336

ATF2, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF2P15336 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF2P15336 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF2P15336 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF2P15336 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF2P15336 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF2P15336 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF2P15336 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF2P15336 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF2P15336 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF2P15336 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF2P15336 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF2P15336 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF2P15336 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF2P15336 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF2P15336 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATF2P15336 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF2P15336 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF2P15336 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF2P15336 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF2P15336 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF2P15336 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF2P15336 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF2P15336 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF2P15336 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF2P15336 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF2P15336 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATF2P15336 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF2P15336 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF2P15336 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF2P15336 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF2P15336 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF2P15336 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF2P15336 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF2P15336 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF2P15336 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF2P15336 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF2P15336 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF2P15336 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF2P15336 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATF2P15336 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF2P15336 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF2P15336 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF2P15336 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF2P15336 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF2P15336 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF2P15336 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF2P15336 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF2P15336 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATF2P15336 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF2P15336 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF2P15336 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF2P15336 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF2P15336 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF2P15336 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF2P15336 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF2P15336 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF2P15336 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF2P15336 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF2P15336 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF2P15336 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF2P15336 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF2P15336 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATF2P15336 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF2P15336 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF2P15336 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF2P15336 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF2P15336 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF2P15336 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF2P15336 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF2P15336 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF2P15336 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF2P15336 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF2P15336 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF2P15336 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF2P15336 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF2P15336 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF2P15336 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATF2P15336 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF2P15336 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF2P15336 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF2P15336 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF2P15336 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF2P15336 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF2P15336 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF2P15336 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF2P15336 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF2P15336 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF2P15336 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF2P15336 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF2P15336 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF2P15336 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF2P15336 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF2P15336 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATF2P15336 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATF2P15336 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATF2P15336 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATF2P15336 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATF2P15336 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATF2P15336 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATF2P15336 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms