Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC5A1P13866 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC5A1P13866 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms