Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCG2P13521 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCG2P13521 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCG2P13521 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCG2P13521 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCG2P13521 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCG2P13521 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCG2P13521 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCG2P13521 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCG2P13521 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCG2P13521 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCG2P13521 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCG2P13521 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCG2P13521 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCG2P13521 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCG2P13521 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCG2P13521 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCG2P13521 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCG2P13521 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCG2P13521 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCG2P13521 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCG2P13521 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SCG2P13521 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCG2P13521 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCG2P13521 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCG2P13521 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCG2P13521 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCG2P13521 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCG2P13521 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCG2P13521 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCG2P13521 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCG2P13521 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCG2P13521 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCG2P13521 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCG2P13521 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCG2P13521 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCG2P13521 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCG2P13521 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCG2P13521 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCG2P13521 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCG2P13521 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCG2P13521 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCG2P13521 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCG2P13521 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCG2P13521 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCG2P13521 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCG2P13521 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCG2P13521 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCG2P13521 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCG2P13521 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCG2P13521 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCG2P13521 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCG2P13521 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCG2P13521 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCG2P13521 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCG2P13521 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCG2P13521 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SCG2P13521 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCG2P13521 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCG2P13521 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCG2P13521 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCG2P13521 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCG2P13521 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCG2P13521 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCG2P13521 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCG2P13521 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCG2P13521 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCG2P13521 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCG2P13521 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCG2P13521 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCG2P13521 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCG2P13521 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCG2P13521 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCG2P13521 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCG2P13521 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCG2P13521 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCG2P13521 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCG2P13521 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCG2P13521 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SCG2P13521 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCG2P13521 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCG2P13521 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCG2P13521 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCG2P13521 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCG2P13521 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCG2P13521 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCG2P13521 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCG2P13521 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SCG2P13521 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SCG2P13521 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SCG2P13521 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCG2P13521 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCG2P13521 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SCG2P13521 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCG2P13521 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCG2P13521 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCG2P13521 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCG2P13521 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCG2P13521 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCG2P13521 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms