Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GP1BBP13224 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GP1BBP13224 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GP1BBP13224 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
GP1BBP13224 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
GP1BBP13224 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GP1BBP13224 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GP1BBP13224 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GP1BBP13224 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GP1BBP13224 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GP1BBP13224 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GP1BBP13224 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GP1BBP13224 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GP1BBP13224 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
GP1BBP13224 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GP1BBP13224 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GP1BBP13224 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GP1BBP13224 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
GP1BBP13224 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GP1BBP13224 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GP1BBP13224 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GP1BBP13224 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GP1BBP13224 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
GP1BBP13224 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
GP1BBP13224 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
GP1BBP13224 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms