Protein–RNA interactions for Protein: P12755

SKI, Ski oncogene, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIP12755 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKIP12755 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SKIP12755 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIP12755 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIP12755 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIP12755 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIP12755 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIP12755 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIP12755 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIP12755 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIP12755 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIP12755 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIP12755 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIP12755 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIP12755 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIP12755 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SKIP12755 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKIP12755 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKIP12755 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKIP12755 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SKIP12755 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKIP12755 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKIP12755 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKIP12755 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKIP12755 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKIP12755 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKIP12755 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SKIP12755 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKIP12755 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKIP12755 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKIP12755 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKIP12755 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKIP12755 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKIP12755 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKIP12755 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKIP12755 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SKIP12755 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKIP12755 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SKIP12755 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKIP12755 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKIP12755 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SKIP12755 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKIP12755 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKIP12755 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKIP12755 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKIP12755 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKIP12755 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKIP12755 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKIP12755 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKIP12755 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SKIP12755 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKIP12755 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKIP12755 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKIP12755 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKIP12755 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SKIP12755 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKIP12755 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKIP12755 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKIP12755 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKIP12755 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKIP12755 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SKIP12755 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKIP12755 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKIP12755 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKIP12755 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKIP12755 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKIP12755 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKIP12755 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKIP12755 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKIP12755 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKIP12755 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKIP12755 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKIP12755 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SKIP12755 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKIP12755 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKIP12755 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SKIP12755 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKIP12755 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKIP12755 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKIP12755 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SKIP12755 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKIP12755 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKIP12755 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKIP12755 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKIP12755 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKIP12755 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKIP12755 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SKIP12755 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKIP12755 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKIP12755 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKIP12755 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKIP12755 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SKIP12755 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKIP12755 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SKIP12755 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
SKIP12755 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKIP12755 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKIP12755 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKIP12755 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SKIP12755 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms