Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BMP3P12645 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BMP3P12645 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BMP3P12645 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BMP3P12645 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BMP3P12645 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BMP3P12645 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BMP3P12645 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BMP3P12645 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BMP3P12645 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BMP3P12645 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BMP3P12645 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BMP3P12645 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BMP3P12645 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BMP3P12645 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BMP3P12645 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BMP3P12645 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BMP3P12645 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BMP3P12645 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BMP3P12645 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BMP3P12645 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BMP3P12645 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BMP3P12645 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BMP3P12645 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BMP3P12645 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BMP3P12645 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BMP3P12645 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BMP3P12645 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BMP3P12645 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BMP3P12645 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BMP3P12645 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BMP3P12645 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BMP3P12645 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BMP3P12645 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BMP3P12645 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BMP3P12645 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BMP3P12645 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BMP3P12645 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BMP3P12645 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BMP3P12645 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BMP3P12645 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BMP3P12645 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BMP3P12645 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BMP3P12645 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BMP3P12645 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BMP3P12645 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BMP3P12645 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BMP3P12645 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BMP3P12645 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BMP3P12645 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BMP3P12645 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BMP3P12645 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BMP3P12645 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BMP3P12645 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BMP3P12645 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BMP3P12645 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BMP3P12645 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BMP3P12645 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BMP3P12645 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BMP3P12645 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BMP3P12645 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BMP3P12645 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BMP3P12645 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BMP3P12645 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BMP3P12645 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BMP3P12645 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BMP3P12645 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BMP3P12645 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BMP3P12645 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BMP3P12645 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BMP3P12645 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BMP3P12645 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BMP3P12645 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BMP3P12645 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BMP3P12645 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BMP3P12645 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BMP3P12645 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BMP3P12645 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BMP3P12645 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BMP3P12645 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BMP3P12645 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BMP3P12645 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BMP3P12645 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BMP3P12645 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BMP3P12645 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
BMP3P12645 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BMP3P12645 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BMP3P12645 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BMP3P12645 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BMP3P12645 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BMP3P12645 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BMP3P12645 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BMP3P12645 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BMP3P12645 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BMP3P12645 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BMP3P12645 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BMP3P12645 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BMP3P12645 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BMP3P12645 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BMP3P12645 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms