Protein–RNA interactions for Protein: P11388

TOP2A, DNA topoisomerase 2-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2AP11388 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC37.97■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC37.96■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
TOP2AP11388 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.94■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC37.93■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.93■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC37.92■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC37.92■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC37.91■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC37.9■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
TOP2AP11388 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC37.86■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
TOP2AP11388 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115 ms