Protein–RNA interactions for Protein: P10745

RBP3, Retinol-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP3P10745 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RBP3P10745 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBP3P10745 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBP3P10745 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBP3P10745 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBP3P10745 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBP3P10745 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBP3P10745 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP3P10745 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP3P10745 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP3P10745 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP3P10745 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP3P10745 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP3P10745 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP3P10745 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP3P10745 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP3P10745 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP3P10745 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP3P10745 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP3P10745 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBP3P10745 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP3P10745 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP3P10745 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP3P10745 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP3P10745 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP3P10745 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP3P10745 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP3P10745 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP3P10745 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP3P10745 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP3P10745 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP3P10745 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP3P10745 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP3P10745 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP3P10745 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP3P10745 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBP3P10745 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP3P10745 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP3P10745 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP3P10745 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP3P10745 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP3P10745 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP3P10745 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP3P10745 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP3P10745 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP3P10745 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP3P10745 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP3P10745 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP3P10745 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP3P10745 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP3P10745 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP3P10745 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP3P10745 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP3P10745 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RBP3P10745 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RBP3P10745 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RBP3P10745 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RBP3P10745 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBP3P10745 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBP3P10745 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RBP3P10745 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBP3P10745 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBP3P10745 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBP3P10745 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBP3P10745 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBP3P10745 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RBP3P10745 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
RBP3P10745 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBP3P10745 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RBP3P10745 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RBP3P10745 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RBP3P10745 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBP3P10745 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RBP3P10745 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBP3P10745 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RBP3P10745 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP3P10745 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP3P10745 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP3P10745 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP3P10745 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP3P10745 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP3P10745 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP3P10745 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP3P10745 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP3P10745 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP3P10745 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP3P10745 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP3P10745 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP3P10745 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP3P10745 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP3P10745 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RBP3P10745 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBP3P10745 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBP3P10745 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBP3P10745 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBP3P10745 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBP3P10745 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBP3P10745 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBP3P10745 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RBP3P10745 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms