Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PTPRFP10586 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPRFP10586 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms