Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC192P0DO97 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCDC192P0DO97 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms