Protein–RNA interactions for Protein: P0DML3

CSH2, Chorionic somatomammotropin hormone 2, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSH2P0DML3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CSH2P0DML3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CSH2P0DML3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CSH2P0DML3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSH2P0DML3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSH2P0DML3 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSH2P0DML3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CSH2P0DML3 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSH2P0DML3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSH2P0DML3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSH2P0DML3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSH2P0DML3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSH2P0DML3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSH2P0DML3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSH2P0DML3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CSH2P0DML3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSH2P0DML3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSH2P0DML3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSH2P0DML3 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSH2P0DML3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSH2P0DML3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSH2P0DML3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSH2P0DML3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSH2P0DML3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSH2P0DML3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CSH2P0DML3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSH2P0DML3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CSH2P0DML3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSH2P0DML3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSH2P0DML3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSH2P0DML3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSH2P0DML3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSH2P0DML3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSH2P0DML3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSH2P0DML3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSH2P0DML3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSH2P0DML3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSH2P0DML3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSH2P0DML3 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CSH2P0DML3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms