Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
RGPD2P0DJD1 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RGPD2P0DJD1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms