Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RGPD1P0DJD0 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
RGPD1P0DJD0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RGPD1P0DJD0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RGPD1P0DJD0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RGPD1P0DJD0 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RGPD1P0DJD0 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RGPD1P0DJD0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RGPD1P0DJD0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RGPD1P0DJD0 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RGPD1P0DJD0 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RGPD1P0DJD0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RGPD1P0DJD0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RGPD1P0DJD0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RGPD1P0DJD0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RGPD1P0DJD0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RGPD1P0DJD0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RGPD1P0DJD0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RGPD1P0DJD0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RGPD1P0DJD0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RGPD1P0DJD0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RGPD1P0DJD0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RGPD1P0DJD0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
RGPD1P0DJD0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RGPD1P0DJD0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RGPD1P0DJD0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RGPD1P0DJD0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RGPD1P0DJD0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RGPD1P0DJD0 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms