Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HOXB7P09629 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
HOXB7P09629 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
HOXB7P09629 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms