Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTAP09496 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTAP09496 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTAP09496 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTAP09496 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTAP09496 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLTAP09496 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTAP09496 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTAP09496 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTAP09496 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTAP09496 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTAP09496 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTAP09496 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTAP09496 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTAP09496 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTAP09496 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTAP09496 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTAP09496 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTAP09496 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTAP09496 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTAP09496 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLTAP09496 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTAP09496 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTAP09496 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTAP09496 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTAP09496 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTAP09496 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTAP09496 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTAP09496 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTAP09496 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTAP09496 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTAP09496 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTAP09496 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTAP09496 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTAP09496 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTAP09496 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTAP09496 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTAP09496 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTAP09496 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLTAP09496 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTAP09496 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTAP09496 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTAP09496 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTAP09496 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTAP09496 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTAP09496 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTAP09496 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTAP09496 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTAP09496 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTAP09496 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTAP09496 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTAP09496 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTAP09496 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTAP09496 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTAP09496 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTAP09496 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTAP09496 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTAP09496 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTAP09496 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLTAP09496 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLTAP09496 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLTAP09496 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLTAP09496 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLTAP09496 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLTAP09496 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLTAP09496 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLTAP09496 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLTAP09496 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLTAP09496 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLTAP09496 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLTAP09496 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLTAP09496 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLTAP09496 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLTAP09496 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLTAP09496 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLTAP09496 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLTAP09496 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLTAP09496 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLTAP09496 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLTAP09496 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CLTAP09496 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLTAP09496 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLTAP09496 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLTAP09496 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLTAP09496 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLTAP09496 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLTAP09496 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLTAP09496 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLTAP09496 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLTAP09496 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLTAP09496 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLTAP09496 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CLTAP09496 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLTAP09496 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLTAP09496 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLTAP09496 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLTAP09496 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLTAP09496 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLTAP09496 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLTAP09496 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms