Protein–RNA interactions for Protein: P07498

CSN3, Kappa-casein, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN3P07498 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSN3P07498 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSN3P07498 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSN3P07498 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSN3P07498 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSN3P07498 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSN3P07498 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSN3P07498 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSN3P07498 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSN3P07498 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSN3P07498 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSN3P07498 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSN3P07498 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSN3P07498 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSN3P07498 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CSN3P07498 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSN3P07498 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CSN3P07498 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSN3P07498 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSN3P07498 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSN3P07498 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSN3P07498 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSN3P07498 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSN3P07498 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSN3P07498 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSN3P07498 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSN3P07498 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSN3P07498 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CSN3P07498 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSN3P07498 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSN3P07498 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSN3P07498 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSN3P07498 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSN3P07498 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSN3P07498 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CSN3P07498 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSN3P07498 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSN3P07498 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSN3P07498 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSN3P07498 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSN3P07498 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSN3P07498 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSN3P07498 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSN3P07498 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSN3P07498 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSN3P07498 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSN3P07498 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSN3P07498 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSN3P07498 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSN3P07498 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSN3P07498 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSN3P07498 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSN3P07498 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSN3P07498 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSN3P07498 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSN3P07498 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSN3P07498 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSN3P07498 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSN3P07498 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSN3P07498 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSN3P07498 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSN3P07498 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSN3P07498 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSN3P07498 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSN3P07498 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSN3P07498 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSN3P07498 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSN3P07498 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSN3P07498 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSN3P07498 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSN3P07498 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSN3P07498 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSN3P07498 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSN3P07498 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CSN3P07498 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSN3P07498 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSN3P07498 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSN3P07498 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSN3P07498 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSN3P07498 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSN3P07498 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSN3P07498 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSN3P07498 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CSN3P07498 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSN3P07498 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSN3P07498 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSN3P07498 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSN3P07498 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSN3P07498 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CSN3P07498 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSN3P07498 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSN3P07498 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSN3P07498 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSN3P07498 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSN3P07498 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSN3P07498 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSN3P07498 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSN3P07498 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSN3P07498 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSN3P07498 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms